农业循环经济的本质经济特征是要使农业资源节约使用—农业废弃物减排甚至零排放—农业产业链闭环延伸。

第一，农业资源在生产流程中循环节约利用。这是农业循环经济最直接的特征表现和目的所在。农业循环经济是把农业经营活动由传统农业“资源—农产品—废弃物”“大规模生产、大规模消费”的线性模式转变成一种“农业资源—农产品—农业再生资源及废弃物利用”物质往复流动的循环模式。首先，在资源投入端适当减少物质能量输入，实现减量化原则是农业循环经济减轻资源环境压力的重要途径。着重考虑延长进入农业生产和生态系统的物质和能量的使用流通过程，使物质资源和能量进入农业循环系统后经过每一级生产环节，实施绿色农业产业化经营，推广农业清洁生产，提高农业生产技术，减少对自然资源的过度开发和使用，适度使用环境友好的“绿色”农用化学品，提高其安全性，控制化肥、农药的施用量，实现环境影响最小化。

农业循环经济强调农业与环境和谐发展的新型模式，目标是追求人口、资源和环境协调发展，让人类在遵守自然环境生态规律的前提下提高农业生产率，统筹考虑各种收益对农业经济可持续发展的影响。

第二，农业生产和消费的废弃物减排。在生产和消费过程末端将废弃物重新纳入农业经济生产循环之中，通过资源再生、物质循环，尽量减少输出到外部环境的物质资源与能量，实现对外部环境的负面影响最小化，以提高资源利用效率和最终废物实现低污染甚至零排放，达到整个经济系统以及生产和消费的全过程无害化要求。随着农业循环经济的发展，农产品深精加工业迅速带动农业产业化进程。农业生产中所产生的废弃物和农产品加工的副产品的回收及综合利用，将推动形成新的以生产和消费的终端废弃物为原材料的产业，并将会在未来取得突破性进展。

第三，农业产业链闭环延伸的产业合作。通过产业链闭环延伸可以形成农业内部和农业与其他产业的合作。在农业内部，大农业中的种植业、畜牧业、林业、渔业相互延伸以及向外延伸到农产品生产加工业、农产品贸易与服务业、农产品消费领域，即农业生态产业链在农业内部和农业与其他产业间延伸，通过废弃物资源化综合利用，以及农业生产要素耦合等方式，形成协同发展的农业产业网络，其资源得到最佳配置，废弃物得到有效利用，环境影响减小到最低水平。而且农业及农业相关产业的原料、产品、废弃物在其上下游产业之间参与循环，上游产业的废弃物成为下游产业的原料，形成一种生态食物链形式，使各个循环主体增强共生互利性，进而促进人类健康、社会与环境良性发展。当前，从农产品的精深加工方面来看，其统一的标准化、兼容性使得农产品循环利用成为显著特征，杜绝一次性农产品消费品的生产，这也是农业循环经济的客观要求。