1909年，卡内基教育基金会请泰勒派人帮助进行教育组织的“经济的研究”，泰勒毫不犹豫地指派了库克。库克用了一年时间，拿出了研究成果《学院的效率和工业的效率》。在这本书里，库克采用科学管理的思路，集中分析大学物理系的投入成本和产出效果。在报告中库克认为，相关的研究结论适用于大学所有系科。之所以选定物理系作为样本，是因为当时人们普遍认为物理系代表了大学的水平。

该书对大学管理中的缺点进行了全面列举和论证，指出大学的主要问题有：人事选拔中的近亲繁殖，聘用本校毕业生的现象十分普遍；学校管理中缺乏投入产出的比较衡量机制，效率甚至比工厂中更低；领导体制中盛行的委员会制，是效率低下的根源之一；权力配置上过于分权，各系自行其是，破坏了整个大学工作的协调；教工的报酬不是以贡献为依据，而是论资排辈；学校普遍没有合理的辞退机制，终身教授制具有强烈的副作用；系主任缺乏实权，影响了正常运营；大学中缺少衡量效率的客观标准。

为了改变这种情况，库克把科学管理的原理和方法应用于大学的管理，并提出了一些具体建议：教授应该把更多的时间用在教学和科研上，应该更多地使用一些助教来负担次要的和辅助性的工作，以便使高级人员能多承担一些复杂的和高级的工作；管理工作应由专家而不是由委员会来承担；教工的报酬应按照其贡献和效率来增长；教授终身制应当废除；教学和科研的经费应由校部更严密地加以控制；建立一种“学生时”（即一个学生上课或做试验一小时的工作量）作为衡量教师工作效率的规范标准等。

库克的这一报告及这些主张虽然受到了某些人的反对，但是这个报告，首开了在公共部门推广科学管理的先河，尤其是学时标准的建立，成为学校管理科学化的基础。