（一）内部贸易的积极影响
1.促进了国际分工和技术进步
跨国公司内部贸易的发展开辟了全球范围内一体化生产的可能性，促进和健全了公司内部网络的形成，即把生产加工的不同阶段分设在不同国家，或者由各子公司专门生产整个生产线的某种特定部件，提高了公司的生产效率，并获得规模经济效益。同时，内部技术贸易还促进了跨国公司根据不同东道国在人才、科技实力及科研基础设施上的比较优势，在全球范围内有组织地安排科研机构，推动技术创新，保持跨国公司的竞争力。据估计，跨国公司垄断了世界上70%的技术转让和80%的新技术工艺。
2.利用转移定价攫取高额利润
内部贸易的产品和服务的价格是由公司管理阶层根据跨国公司的全球战略目标制定的，通过转移高价和转移低价可使整个公司的经营活动在全球战略目标指导下实现内部交换，在协调的基础上使各自的利益得到满足，并可减轻税负，实现内部资金配置，避免外汇汇率风险和东道国的外汇管制。例如，当跨国公司子公司所在国的外汇管制和利润汇出限制严、营业利润抽税高时，母公司就抬高供应给子公司的机器设备、原材料和劳务的价格，使子公司生产成本增加，盈利减少，从而少纳税；当子公司产品面临当地产品竞争时，母公司可以大幅度降低转移价格，从而降低子公司产品的生产成本，增强其竞争能力，以价格打垮竞争对手；当所在国货币将要贬值时，母公司就可以利用转移价格将子公司的利润和现金尽快汇出去；当子公司所在国货币坚挺时，母公司就利用转移价格使子公司扩资，从汇率中牟利。由此可见，转移价格已成为跨公司弥补外部市场结构性和交易性缺陷的重要措施，它既是跨国公司建立内部市场的重要手段，也是跨国公司内部贸易的强大支撑点，为其最终获取高额利润起了重大作用。
3.保持跨国公司的技术优势
对技术的垄断是跨国公司的特有优势，也是其存在和发展的关键。如果公司的技术产品在公司外部交易，就有可能被竞争对手摹仿而受损失。内部贸易有助于公司增强在国际市场上的垄断地位和竞争能力，实现全球利益的最大化。实践证明，实行内部贸易与公司拥有的技术水平有关，其技术水平越高，内部贸易的比重就越大。据邓宁教授研究，母公司内部出口贸易在总出口中的比重，计算机工业为91.3%，石油工业为51%，汽车工业为62.4%，电子工业为36.5%，纺织业为12.8%，食品业为9.8%。
4.有利于平衡跨国公司内部各方利益关系
内部贸易解决了跨国公司内部相对利益中心之间的矛盾，有利于公司高层人才的稳定。跨国公司的各个子公司虽然隶属于同一母公司，但各子公司又是独立的利益主体，即使是从母公司全球战略的大局出发，也应考虑到各个主体的利益要求，以保证工作人员的稳定，维持整个公司的凝聚力。因此，在内部交换过程中，跨国公司不能以利益的完全一致性为基础进行无偿调拨，而必须采取贸易形式，通过内部市场机制满足各方的经济利益，以解决内部经济利益的矛盾。
5.规避经营风险
内部贸易降低了外部市场造成的经营不确定风险，有利于跨国公司实行计划管理。完全受市场自发力量支配的企业经营活动面临诸多风险，如投入供应数量、质量、价格等不确定，以及不同生产工序和零部件由独立企业承担，不易协调等。公司内部贸易可以大大降低各种经营的不确定性，使公司的商品数量、商品结构及地理流向都服从于公司长期发展战略计划、生产投资计划、市场营销计划和利润分配计划，优化公司内部的资源配置，使之不断适应公司发展战略的外部环境要求，在激烈竞争的环境中立于不败之地。
（二）跨国公司内部贸易的负面影响
从前面的分析可知，内部贸易在跨国公司资本运营中的作用功不可没，但也带来了一系列的负面影响。
1.扭曲价格形成机制
转移价格的定价机制改变了价格作为市场信号的贸易秩序。母公司与子公司在转移产品、服务、资金时，人为地调高或调低价格与收费，在一定程度上削弱了市场自由竞争赖以存在的价格机制，破坏了国际市场价格与供求关系之间的联系。因此，内部贸易减弱了价格作为市场信号的作用，在一定程度上干扰了原本以市场价格为基础的贸易秩序，使世界市场上通过传统的“自由市场”按照公平条件进行的交易所占比重不断减少，而通过“封闭”市场进行的交易则日益扩大。
2.损害东道国利益
转移价格往往损害了东道国的利益。由于内部贸易采用转移价格手段，达到跨国公司的特定目标，如将资金调出东道国，规避东道国的税收，绕过东道国的关税壁垒等。跨国公司通过转移价格侵吞了东道国合资方的利润，减少了东道国的税收收入。
内部贸易降低了东道国引进外资的关联效应。很多东道国，特别是发展中国家，大力引进外资的目的之一就是希望通过跨国公司的投资带动上游产业或下游产业的发展。然而跨国公司从全球战略出发，有时宁可高价进口国外关联公司的原材料、半成品，降低了跨国公司在东道国直接投资的关联效应。例如，某合资企业生产用的主要原材料阿苯达唑，国内许多厂家能生产，而且产品质量很好，但该企业的合资外方却拒绝使用高质价廉的国产原料，而高价从其他国家的子公司进口。
3.跨国公司的内部贸易使国际关系复杂化
跨国公司的内部贸易在一定程度上扰乱了传统的国际贸易格局和秩序。一方面，跨国公司通过内部贸易侵占了东道国的利益，破坏了东道国的投资声誉，而且使东道国在制定经贸政策时左右为难；另一方面，内部贸易中的返销活动使得进口国、出口国的地位改变，改变了双方的贸易差额，不利于改善东道国的国际收支。这些矛盾显然会造成国际经贸关系复杂化。
由此可见，跨国公司的内部贸易是国际贸易发展的一把“双刃剑”。如何运用好这把“双刃剑”已引起世界各国普遍关注。美国、法国、日本等拥有大量对外直接投资的发达国家，都已制定专门法规，限制跨国公司转移价格的作用。而发展中国家与跨国公司打交道的时间短，缺乏经验，要管制转移价格就比较困难。发展中国家应该从完善法令、法规入手，加强对外资企业财务报表的审核，并及时了解国际市场价格的变动情况及有关国家的税率差别，了解国际市场同行业利率水平，及时发现问题，以对跨国公司转移价格进行限制，扬长避短。